Работа сканеров во многом зависит от его типа - SCSI/LPT/USB/..., т.к. сам интерфейс TWAIN поддерживается. Также информация о поддержке сканеров есть здесь.
Если в компьютере eComStation что-то не работает (USB глючит / сеть медленно / только 1 процессор / программы часто падают) - это не повод удалять ОС. Надо ее настроить. Вопросы и ответы eCSFAQ